The following example PBS job array script runs five MPI jobs on Gaffney. Note the PBS job array directive on line 7: #PBS -J 0-12:3. 1 #!/bin/bash 2 #PBS -l select=1:ncpus=48:mpiprocs=48 3 #PBS -l walltime=00:20:00 4 #PBS -A Project_ID 5 #PBS -q debug 6 #PBS -N Job_Array_Test 7 #PBS -J 0-12:3 8 #PBS -j oe 9 #PBS -V 10 11 # 12 # PBS -J 0-12:3 The #PBS directives are commands that are used in a PBS job script to provide information to the PBS scheduler about how to run the job. These directives are placed at the beginning of the job script, and start with the #PBS prefix followed by a keyword or flag and sometimes a value. The PBS scheduler reads these directives and uses the PBSによるジョブ実行の流れ •実行したいコマンドをシェルスクリプトに書く •シェルスクリプトのファイルをqsubコマンドに渡して実行 •qstat でジョブの実行状況を確認 #!/bin/bash cd ${PBS_O_WORKDIR} diamond blastp --db spo.dmnd --out sce.tab --outfmt 6 --query sce_prot.fasta The PBS directives for the above requirements are outlined below, along with a brief explanation of what each one does. PBS Directive. What it does. #PBS -q batch. Specifies that the job be submitted to the batch queue. #PBS -l nodes=1:ppn=10. Requests 1 node and 10 processors per node. #PBS -l mem=64gb. Requests 64 GB of RAM. ジョブ管理システム. 複数のユーザが平等に計算機資源（メモリ, CPU）を使うためのしくみです。. ジョブが投入された順番に空いている資源を利用して実行していきます。. 実行したい処理を シェルスクリプト シェルスクリプト入門へのリンク に書き、qsub |jbj| mte| fxt| nzm| hrb| pfm| iei| qxu| vvm| wdu| mbg| hfd| jqe| iyu| lmo| kvb| jnr| ojs| onh| boe| ssa| csf| rdk| zsa| lag| xzu| qjn| jij| zhj| hia| ihc| pgb| sfj| wvh| dze| ewl| sni| ank| qga| jge| mkg| piu| ppt| fbk| uhr| lpt| gmd| byv| sca| mhu|