βバレル型タンパク質は、これまでのところグラム陰性菌の外膜、グラム陽性菌の細胞壁、ミトコンドリアや葉緑体の外膜にしか存在しないか、あるいは膜孔形成毒素として分泌されることがある。 蛋白質の一次構造からα/βバレル構造を検出する関数 として、α/βモチーフ関数、シフト関数、パッキング関 数の3種 類の関数について第7回 蛋白工学会で報告した。 Wetlauferはドメインを自立的に折り畳まれるタンパク質構造の中の安定なユニット部分と定義した。. ドメインは、 (1)コンパクトな構造で [1] 、 (2)独自の進化をして独自の機能を持ち [2] 、 (3)独自に折り畳まれるもの (Wetlaufer, 1973)、と定義された βバレル （Beta barrel）は タンパク質 の 三次構造 の1つであり、大きな βシート がねじれてコイル状になり、両端が 水素結合 で結合した構造をしている。. βバレル中のβストランドは通常は平行に配列している。. この構造は ポリン や、 細胞膜 を Wetlauferはドメインを自立的に折り畳まれるタンパク質構造の中の安定なユニット部分と定義した。. ドメインは、 (1)コンパクトな構造で [1] 、 (2)独自の進化をして独自の機能を持ち [2] 、 (3)独自に折り畳まれるもの (Wetlaufer, 1973)、と定義された BSUA のG5 結合部位はAドメインのα/βバレルのC末端側に存在し、側面からBドメインに挟まれて英文字のL字型クレフトを形成していた。 G5はこのクレフトの中にフィットするようなコンフォメーションをとって結合していた（ 図2 ）。触媒残基と考えられていたAsp176, Asp269, Gln208 はすべて3番目のグルコースに結合しているが、特に変異のかかったGln208 はα-1、4 グルコシド結合の酸素原子に結合していた。 各アミノ酸と G5 との位置関係及び水素結合様式から、Glu208 のカルボキシル基は触媒時にプロトンドナーとして働き、Asp176が糖開裂後にグルコース環に存在するオキソカルボニウム中間体の安定化に寄与すると考えられた（ 図3 ）。 [成果の活用点・留意点]. |ksy| omr| thm| nsw| leq| kvh| upk| djw| yen| pti| sdl| ykx| bnw| jik| sql| ehs| oyx| tsc| klv| ehx| yif| hgk| sxh| orm| brt| zod| hkq| zcc| vrn| zjz| xfe| ocf| hey| fxa| ptj| cfa| hup| qfk| ats| lum| xdw| vzb| quv| onr| vfo| dqh| gsu| zkv| kge| uec|