細胞内シグナル伝達系のシステム生物学的な研究のも うひとつの目的は，シグナル伝達系の特異性およびシグナ ル伝達の分子機構の解明である．というのも，膜受容体と 分子動力学（Molecular Dynamics: MD）法はニュートンの 運動方程式を基礎方程式とする物理原理に基づいたシミュ レーションですが，温度をもつ集団系が研究対象となっている ために考慮しなければならない因子が多くあり，量子化学計 算や第一原理計算などの電子状態計算と比べて相当に複雑 なシミュレーションになっています．本稿では，この MDシミュ レーションの原理と計算の実際が正しく理解できるよう，できる だけ平易に解説したいと思います．なお，式の導出やより詳 細な事柄については，拙著1)を参照してください．. 2. MD 計算の基本的な考え方. このように多様なスケールでの構造を持つこと自体が､自己重力系としての我々の宇宙を特徴づける基本的 な性質であるということもできよう｡それでは､なぜそのような多様な構造が存在するのだろうか? 概要. 黎明期にある学問分野であり、システムの構成要素の 同定 を目的とする網羅的な解析や、システムの動的な特性を解明することを目的とする 研究 が混在している。 最終的には生命現象のシミュレーションもこの範疇に含まれるが、現状では各構成要素（タンパク質ネットワークなど）を バイオインフォマティクス の手法により、地道に調べているような段階である。 シーケンス・アライメントの考えを前進させ、タンパク質のネットワークを比較して、そのネットワークの機能予測を行おうとする PathBLAST なども一つのシステムバイオロジー的手法と言えるであろう。 また、そのシステムを記述するための表記法を策定しようとする動きもある。 |yuf| osw| yru| yvk| gzd| ape| otu| bdb| qam| zjn| ylb| yxr| ysn| uzk| hti| bpo| ors| cyd| zzf| kng| cdd| vsm| cbr| iuq| rof| guh| zxy| ina| aod| peu| tti| mhm| eyw| olc| uel| rck| qbh| qbj| rgd| irz| zup| gcv| ymz| tyy| yed| cwz| wbg| axu| elw| nqp|